当センターは、旭川歯科医師会が組織する「道北口腔保健センター運営委員会」によって、運営されています。
診療担当の運営委員のほか、数名の協力医（市内の開業医）が診療にあたっています。
所長は、障がい者歯科認定医、小児歯科認定医を取得している専門医です。